Prvenstvo Jugoslavije u sezoni 1999/00 Zvezda je osvojila gol razlikom 85:19. Na kraju prvenstvene trke naš tim je imao 105 bodova a drugoplasirani Partizan četiri manje. Trener Slavoljub Muslin je doneo sedmu Duplu krunu u vitrine Muzeja FK Crvena zvezda.

Igrački kadar:
Aćimović Milenko, Bajčetić Srđan, Bjegović Nikoslav, Bošković Branko, Bunjevčević Goran, Vitakić Milivoje, Vukomanović Ivan, Georgioski Blaže, Glogovac Stevo, Gojković Jovan, Gvozdenović Ivan, Dudić Ivan, Drulić Goran, Ilić Dejan, Jelić Branko, Kocić Aleksandar, Lalatović Nenad, Lerinc Leo, Markovič Marjan, Mićić Dragan, Miljković Nenad, Mirković Vladislav, Pantelić Miodrag, Pešić Dejan, Pjanović Mihajlo, Stevanović Dragan, Stojanović Boban i Škorić Dalibor.

Trener: Slavoljub Muslin

U sezoni 2000/01 Crvena zvezda je osvojila 22. titulu u prvenstvu Jugoslavije, uz gol razliku 93:20 i osvojenih 28 pobeda, 4 remija, 2 poraza i 88 bodova.

Igrački kadar:
Aćimović Milenko, Bajčetić Srđan, Bošković Branko, Bunjevčević Goran, Vitakić Milivoje, Vukomanović Ivan, Georgioski Blaže, Glogovac Stevo, Gvozdenović Ivan, Drulić Goran, Đenić Petar, Zorić Saša, Ilić Dejan, Jelić Branko, Kocić Aleksandar, Lalatović Nenad, Lerinc Leo, Markoski Jovan, Marković Marjan, Matijašević Vladimir, Mirković Vladislav, Pešić Dejan, Pjanović Mihajlo i Stevanović Dragan.

Trener: Slavoljub Muslin

Sezonu 2003/04 obeležio je najbolji strelac Lige – Nikola Žigić sa 18 golova. Zvezda je, pod vođstvom trenera Slavoljuba Muslina, uzela svoju osmu Duplu krunu. Prvenstvo Srbije i Crne Gore osvojeno je uz gol razliku 59:13 i 74 boda, devet više od drugoplasiranog Partizana.

Igrački kadar:
Basta Dušan, Beljić Nikola, Bogavac Dragan, Bogičević Jadranko, Bošković Branko, Vidić Nemanja, Vitakić Milivoje, Dišljenković Vladimir, Dudić Ivan, Dudić Milan, Đorđić Bojan, Đorđević Slavoljub, Žigić Nikola, Ilić Dejan, Janković Boško, Kovačević Nenad, Krivokapić Radovan, Marković Marjan, Miladinović Bojan, Milovanović Dejan, Mladenović Dragan, Mrđa Dragan, Muslin Marko, Orahovac Sanibal, Pantelić Marko, Perović Marko, Ranđelović Ivan, Stojanović Nenad i Šarac Dragan.

Trener: Slavoljub Muslin

24. titula u prvenstvu je osvojena uz gol razliku 73:23, i 78 bodova. Zvezda je te sezone ostvarila 25 pobeda, 3 remija i 2 poraza. Prvi inostrani trener na klupi našeg kluba je bio Valter Zenga koji je odmah uspeo da osvoji duplu krunu. U kvalifikacijama za Ligu UEFA savladan je Inter iz Zaprešića ukupnim rezultatom od 7:1. U Portugalu protiv Brage Crvena zvezda je uspela da se plasira u takmičenje po grupama. Vrhunac tadašnjeg crveno-belog evropskog pohoda bila je utakmica protiv Rome na Marakani, pobeda od 3:1 i blistava partija Nikole Žigića. Sportska sreća nam je na kraju okrenula leđa u poslednjoj utakmici u Strasburu, da bi posle remija od 2:2 ipak ostali bez prolećnog takmičenja u Ligi UEFA.

Igrački kadar:
Anđelković Dušan, Basta Dušan, Banović Zoran, Biševac Milan, Vuković Jagoš, Draman Hamini, Dudić Milan, Đokaj Ardijan, Đokić Dušan, Đorđević Filip, Žigić Nikola, Janković Boško, Joksimović Nebojša, Kovačević Nenad, Krivokapić Radovan, Luković Aleksandar, Mijović Igor, Miladinović Bojan, Milijaš Nenad, Milovanović Dejan, Mladenović Dragan, Mrđa Dragan, Mudrinić Vladimir, Pantelić Marko, Perović Marko, Purović Milan, Ranđelović Ivan, Rašković Milanko, Stojanović Boban, Stojković Vladimir, Suzuki Takajuki, Tomović Nenad i Trajković Nikola.

Trener: Valter Zenga

U sezoni 2006/07 osvojena je deseta dupla kruna, pod vođstvom trenera Boška Đurovskog. Zvezda je osvojila trofej prvaka države tri kola pre kraja prvenstva, sa 74 boda, gol razliku 55:27, 23 ostvarene pobede, 5 remija i 4 poraza.

Igrački kadar:
Adamović Goran, Anđelković Dušan, Ailton Gonsalves Da Silva, Bajalica Miloš, Basta Dušan, Banović Zoran, Biševac Milan, Burzanović Igor, Gaj Ibrahim, Georgijev Blago, Đokić Dušan, Đorđević Vladimir, Žigić Nikola, Janković Boško, Joksimović Nebojša, Kastiljo Segundo Alehandro, Kovačević Nenad, Koroman Ognjen, Krivokapić Radovan, Miladinović Bojan, Milijaš Nenad, Milovanović Dejan, Nikolić Marko, Pantić Aleksandar, Perović Marko, Perović Slavko, Purović Milan, Radivojević Saša, Ranđelović Ivan, Rašković Milanko, Reljić Milan, Srećković Nenad, Tadeu Eli, Trajković Nikola, Trišović Aleksandar i Tutorić Đorđe.

Trener: Boško Đurovski